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吴郭鱼具说有淡水养殖，也有海水养殖的吴郭鱼，那么吴郭鱼不是是属于淡水鱼类呢?从中国水产上报道来看吴郭鱼是全球最重要的淡水养殖鱼类之一，但也有耐盐又成长快的海水吴郭鱼。
中国水产频道独家报道，吴郭鱼是全球最重要的淡水养殖鱼类之一，具有快速成长特质，但价格却并非高档且偶有滞销跌价情形。农委会水产试验所选育具耐盐性能海水吴郭鱼品系TFS，可与一般吴郭鱼品系杂交，选育既耐盐又成长快的海水吴郭鱼。
Spilirus品种在1981年自沙乌地阿拉伯引入，本种在国外即已知可在35‰盐度下养殖(黄家富提供)吴郭鱼(Tilapia)隶属于硬骨鱼纲(Osteichthyes)、鲈形目(Pecirformes)慈鲷科(或称丽鱼科Cichlidae)，约有100多种。慈鲷科鱼种的分类较困难，一直存在争议。一些文献曾将各种慈鲷鱼笼统地归为Tilapia属。目前最为广泛接受的是Trewavas(1982)的分类法，将吴郭鱼分为非鲫属(Tilapia属，如T.zillii、T.rendalli、T.congica、T.guineensis)、帚齿非鲫属(Sarotherodon属，如S.galilaeusgalilaeus、S.melanothernmelanothern)及口孵非鲫属(Oreochromis属,如O.niloticus、O.mossambicus、O.aureus、O.mortimeri)等3个属。台湾1946年引进吴郭鱼，在品种改良后，养殖面积及产量迅速扩大，在2001年产量即已超越8万吨，近十余年产量都在6.7万吨以上。过去吴郭鱼以内销为主，自1993年起才开始外销，该年台湾吴郭鱼之总生产量为5万多吨，外销量约为1万吨，其后外销量逐年递增，2003年外销量已经达到约4万吨，占总生产量47%。
我国台湾地区历年吴郭鱼统计图由于价格合理、全年供应、味道适中以及便于烹制，2004年吴郭鱼成为美国第八大受欢迎的海产品，许多速食连锁店都销售吴郭鱼，最初出口的吴郭鱼是来自我国台湾的冷冻整鱼。美国市场也喜欢吴郭鱼片，鱼片产品包括不同规格和包装的新鲜或冷冻鱼片。水试所选育海水吴郭鱼目前养殖业淡水资源限缩和地层下陷的问题日益严重，吴郭鱼的海水养殖具有发展前景，与淡水吴郭鱼相比，海水吴郭鱼最大的优势在于其较佳的口感和肉质，价格也较高。农委会水产试验所水产养殖组研究员曾福生指出，台湾坊间虽然也有耐盐度之海水吴郭鱼品系，却碍于生长速度慢、养殖时间长、养殖成本高而推广困难。水试所团队利用基因标志辅助育种技术，从台湾地区现有的吴郭鱼养殖种类中，针对海水吴郭鱼育种的关键点-成长和耐盐性状上，以杂交育种方式来改良成长不佳的缺点，进而选拔体型优、带有尼罗血统的吴郭鱼，经进行海水驯养，再逐代依体型及体色进行亲鱼选育，建立体型佳的海水吴郭鱼品系，所选育的海水吴郭鱼品系体型比坊间莫三比克品系大，以这个品系作为耐盐性状遗传资料，可以和一般吴郭鱼品系进行杂交获得商业用耐高盐度杂交鱼苗。
水产试验所海水吴郭鱼TFS 品系之外观形质水试所是针对红色吴郭鱼TsR和TsRn品系进行海水驯化，TsR品系是从淡水环境连续数代选育而来，属莫三比克吴郭鱼血统，本来就比较能适应全海水，甚至能在海水环境繁殖，但是这个品系成长慢;而TsRn品系是从红色尼罗吴郭鱼选育而来，对海水环境的适应差，但随着成长对海水环境的适应也跟着提升，不过仍无法长时间生长在超过25‰的环境。水试所进一步挑选耐盐红色吴郭鱼TsRn品系和海水吴郭鱼TFS品系，进行全互交配对，产下后代并在海水环境驯养。曾福生指出，选育结果显示耐盐性与吴郭鱼品系有关，具有物种差异性，且海水吴郭鱼TFS对子代之耐盐性扮演决定性的关键角色，反交组(TFS×TsRn)仔鱼外表型，体色的表现皆为红底色具黑斑或黑点。淡水品系只能在半咸水养殖圣鲷水产科技2013年透过技术移转与水产试验所合作，引进水试所的海水吴郭鱼品种TFS与自场红色吴郭鱼品系(SDR)杂交，历经3年培育出具有快速生长基因可在一般海水养殖的吴郭鱼，在今年将可生产第一批10万尾做商业化养殖的鱼苗。
台湾圣鲷水产科技与水试所技转合作，培育海水吴郭鱼，杂交子代有红、黑、灰三种体色，可在盐度30‰海水中养殖圣鲷水产科技创办人黄成贤表示，吴郭鱼虽然是广盐性，但一般为淡水养殖，以加快成长速度缩短养殖期，就算提高盐度养殖，最多也只能到20‰，盐度超过20‰会导致鱼体皮肤溃烂，而圣鲷海水吴郭鱼能适应30‰的海水盐度。
TFS×TsRn 杂交2月龄子代，具有大量深色黑斑的黑体色子代吴郭鱼纯海水养殖是一大突破，因为吴郭鱼属杂食性动物，饲料蛋白质需求低，而且可以采用植物性蛋白，等于是“吃素”，比较不会破坏生态。养殖的海水鱼类许多是肉食性，例如石斑鱼，需要靠大量地投喂下杂鱼，按照其饲料效率计算，养1万吨海水鱼需要5万-6万吨饵料鱼，大量养殖有造成海洋食物链短缺的疑虑。即使是饲喂人工配合饲料，也是需要高比例的鱼粉，对海洋渔业资源同样是一项负担。而海水养殖的杂食性吴郭鱼，将有望改善“养殖鱼破坏海洋生态”的局面。圣鲷水产科技董事长黄一圣说，由于海水吴郭鱼品系目前尚未有商业化养殖的成长数据，不过在育种研发阶段的观察，使用尼罗鱼饲料，一天只喂一餐的情况下，从米粒大小的幼苗成长到1台斤大约是7个月的时间，长到3-4台斤大约要一年多，有些鱼去年2月放养，今年5月体型已达到1.5-2公斤。
此杂交子代之母本为红色，父本为黑色海水盐度高，因渗透压的关系，鱼体细胞要防止海水盐类渗透进来，细胞为了要排出过多的盐类留下水分，耗费较多能量，所以成长相对比在淡水环境下来得慢。不过同一条鱼，在海水养殖的肉质会比较Q弹扎实、没有臭土味，适合做生鱼片及清蒸等料理，价值也比较高。海水吴郭鱼苗倍体化吴郭鱼是成长快速的鱼种，但在未达上市体型即达性成熟，有许多缺点，首先是性成熟早，造成仔鱼为患，是鱼池管理上的一大困扰，也浪费饲料，增加成本;其次，鱼体得花费大量能量以生产精子或卵子，使体成长减慢，造成饵料转换系数提高;第三，生殖后鱼肉品质变差，且产卵后身体虚弱，造成死亡率提高。黄成贤指出，人工养殖鱼种在开放水域养殖都有逃脱的可能，该场目前正尝试倍体化育种的可能，期望未来能改善这类养殖问题，但为了避免疑虑，目前初期推广以陆上循环水养殖池为主要合作对象，食安的标准向欧盟看齐。
圣鲷水产科技以水产试验所的海水吴郭鱼TFS品系，自场红色吴郭鱼品系SDR，杂交产生耐盐且生长快的海水吴郭鱼，子代有红、黑、灰三种体色表现圣鲷正在慎选合作养殖对象，推广今年产出的海水吴郭鱼。黄一圣指出，海水吴郭鱼的推广“重质不重量”，合作的养殖场以循环水养殖系统为主，这条鱼虽然也可以养在海上网箱，但目前尚不考虑。海水吴郭鱼将朝向产业精细化发展，结合种鱼场、循环系统养殖场及末端冷冻加工厂，提高品质及价格，打品牌区隔市场做永续经营。黄一圣指出，中国也有一个耐盐度的Tilapia品种，但是该品种必须用人工产卵方式培育，而圣鲷的可以用自然产卵繁育杂交子代，大陆品系只能到25‰的盐度，台湾海水吴郭鱼可以到30‰，两者的亲本也有所不同。
圣鲷水产科技创办人黄成贤(左)表示圣鲷海水吴郭鱼品系能适应30‰的海水盐度，右为圣鲷董事长黄一圣据了解，中国大陆的的耐盐罗非鱼新品种，命名为“吉鲡”，是以尼罗罗非鱼(O.niloticus)新吉富品种(NEWGIFTvariety)为母本，萨罗罗非鱼(Sarotherodonmelanotheron)为父本，杂交产生的耐盐新品种，可在盐度15‰-25‰海水中养殖。吉鲡罗非鱼是上海海洋大学教授李思发经过多年选育，在2009年11月9日南宁“第六届罗非鱼产业发展论坛”上发表。海南省海洋与渔业科学院于2010年在引进耐盐性海水“吉鲡”罗非鱼，研究和南美白对虾混养技术。南美白虾苗放养密度1万尾/亩，15-20天后，投放平均体长为2.17cm的吉鲡罗非鱼鱼苗4万尾，经6个多月的养殖，“吉鲡”罗非鱼平均体重达到398.6g，成活率达到89.45%，亩产罗非鱼764.0kg。
