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选择苹果做为健康饮食的一部份时，许多人第一个想到的都是多汁香甜的果肉。但是，苹果防癌和促进健康的能力，和吃下的部分密切相关。喝苹果汁代替真正的水果，或是舍弃苹果皮，都会让你错失苹果中许多关键的营养成分!
苹果皮有助防癌，和果肉一起吃效果更好近年有研究分析指出，苹果皮对前列腺癌和乳癌具有正面效果。癌细胞会关闭身体的一种自然防御机制，而根据医学博士Michael Greger的解说，苹果皮能够再度启动抑制癌症的蛋白质maspin。另外，苹果皮含有三萜类合物，具有显着的抗癌功效，特别是针对肝癌、肠癌和乳癌。一般认为，苹果的果皮和果肉一起食用，更能共同作用、抑制常见疾病，包括心脏病、肺癌、气喘、肥胖、失智、阿兹海默症等。苹果富含植化素、维生素、纤维和大量抗氧化物质。只要吃一颗苹果，就能满足10%以上的每日所需维生素C和膳食纤维。纤维能够提供饱足感、减少过食的可能性，并预防和数种癌症相关的体重上升;维生素C则能够预防自由基造成的损害。另外，肠道细菌也会利用苹果中的主要膳食纤维─果胶，制造化合物保护肠道细胞。
近期也有研究指出苹果具有减低肺癌风险的能力。在《护士健康研究》和《健康专业人员追踪研究》中，规律摄取蔬果，和女性降低21%肺癌风险有关。
一项超过一万位男女性参与的芬兰研究发现，摄取较多类黄酮，与减少肺癌扩散具有强烈相关性。多数研究参与者的主要的类黄酮来源是苹果，研究者因此推论，苹果中的类黄酮最有可能降低癌症风险。康乃尔大学的食物科学家则发现，喂食老鼠的苹果萃取物相当于人类每天吃一颗苹果后，老鼠的肿瘤发生率减少了25%。若喂食的萃取物等量于一天三颗苹果时，更减少了61%。
苹果表面会产生天然果蜡，防止水分散失，但为了防止变质、保持卖相，许多商贩还会在苹果外皮涂上人工果蜡。 《食物安全就要这样吃》一书指出，想要去除苹果表皮的果蜡，可以用温水或热水冲洗，再用牙刷轻轻刷洗，即可去除果蜡。生机饮食专家王明勇则建议，利用柠檬皮或果肉，沾少许小苏打粉和盐巴后，反覆搓洗苹果表面，将果蜡打磨掉后，再以清水冲洗干净即可。
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